Jährlich richtet das WHG im Vorfeld des Tages der offenen Tür die dreitägige “Heisenberg-Akademie” aus. Schülerinnen und Schüler der benachbarten Grundschulen und der Sekundarschule Leverkusen sowie ein WHG-Schüler oder eine WHG-Schülerin aus jeder 5. Klasse werden dazu von ihren Klassenleitungen nominiert und angemeldet. An zwei Tagen experimentieren und forschen die ca. 40 Kinder dann in vier Workshops zu unterschiedlichen MINT-Themenbereichen in den naturwissenschaftlichen Fachräumen der Schule. Dabei werden sie von Fachkolleginnen und Fachkollegen des WHG sowie von engagierten Oberstufenschülern oder -schülerinnen angeleitet. Ein Tagesausflug mit naturwissenschaftlichem Bezug rundet die Akademie ab. Die Eindrücke und Ergebnisse der Heisenberg-Akademie werden am Tag der offenen Tür von den Teilnehmenden vorgestellt.